苏州市吴江区儿童医院外科由急诊、门诊及病房组成，其中急诊24小时开放，负责各类外科急危重病人的一线接诊及转送。门诊现设置有外科专家门诊（苏州大学附属儿童医院专家轮流坐诊）、外科普通门诊、骨科专科门诊、骨科专家门诊、泌尿专家门诊、手外科专家门诊、心胸外科专家门诊及夜间外科门诊。病房于2020年07月中旬正式开放，目前共有两个病区，开放床位84张，其中6个家庭单人间。七病区分为新生儿外、普外、泌尿外和烧伤整形专业组，八病区分为骨科、手外科和耳鼻喉专业组。现有医生15名，其中副主任医师2名，主治医师3名，住院医师10名。硕士生导师1名，博士2名，硕士11名。护理28名，其中主管护师3名，护师3名，护士22名。共同负责日门诊、夜门诊、急诊、手术及两个病区的运行及管理工作。